專案詳細資料
說明
前言 過去研究僅針對施打B型肝炎疫苗追加劑是否產生保護力進行全基因組關聯(Genome Wide Association Studies, GWAS)或人類白細胞抗原(Human Leukocyte antigen, HLA) DRB1、DPB1分型的研究。對於次世代高通量定序(Next generation sequencing, NGS)的研究與HLA class II (HLA-DPA1, DQA1/B1, DRA1)的分型則仍然缺乏,且對於具備長期保護力維持、完全無維持力與B型肝炎病毒表面抗體效價殘留的三種免疫狀態的HLA分型與單核苷酸多形性(Single-nucleotide polymorphism, SNP)研究尚未有研究進行觀察。因此本篇研究預針對全國B型肝炎疫苗施打計畫覆蓋族群依其不同免疫狀態進行HLA分型及其基因的NGS分析。 材料與方法 欲針對出生於1986年後於台北醫學大學附設醫院家庭醫學科門診病患檢測HBsAg (hepatitis B virus surface antigen) 、 HBcAb (hepatitis B virus core antibody) 、 與HBsAb (hepatitis B virus surface antibody)項目。參與此計畫之受試者除年齡須於1986年七月後出生、年滿二十歲、初生完成B肝疫苗注射後並無B肝疫苗追加史且無任何重大傷病史及長期使用慢性處方病史。女性參與者則另需排除懷孕者。 依其HBsAg與HBsAb血清學狀態進行分組。對照組為施打疫苗前HBsAb高於100mIU。病例組將依其對B肝疫苗反應分為(a) 在施打完第一劑B肝疫苗追加後,其HBsAb > 100mIU;(b) 在施打完三劑B肝疫苗追加後,其HBsAb > 10mIU;(c) 在施打完三劑B肝疫苗追加後,其HBsAb < 10mIU。所有血液樣本利用IMMUCORR出產以PCR reverse SSO(Sequence Specific Oligonucleotide) 原理的LIFECODES系列進行HLA分型,NGS技術以Illumina Genome Analyzer II系統完成。 預期結果 在不同HBsAb效價維持力的族群中應能觀察到HLA-DRB1分型應證過去文獻,並發現HLA-DPA1/B1特定分型,甚至HLA-A, -B, -C在不同免疫狀態的分佈。並且利用NGS分析其HLA片段應能找到特定的SNP,這些結果除能與過去文獻相呼應外,由於比起過去文獻使用GWAS,我們使用次世代定序分析,應能找出更多潛在HLA片段的SNP。本次的研究完整說明HLA在不同B型肝炎疫苗免疫狀態的影響,並提供疫苗追加劑施打與否的參考。
狀態 | 已完成 |
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有效的開始/結束日期 | 8/1/16 → 7/31/17 |
Keywords
- 人類白細胞抗原
- 單核苷酸多形性
- B型肝炎疫苗
- 次世代高通量定序
指紋
探索此專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。