運用癌症基因表現建構癌症相關生物路徑

生物路徑是生物體內最重要的生物過程之一。在今日，預測或重構路徑的研究都 要仰賴電腦方法搭配基因組學與蛋白質組學的資訊。然而，即便如此，我們在路 徑研究上對於全規模基因組與大規模蛋白質組的運用仍然有限。在龐大的蛋白質 交互作用網路中尋找出有意義的生物路徑是很困難的。另一方面，基因表現又比 蛋白質交互作用更貼近路徑的調控。所以，我們提出了一個可以整合基因表現與 蛋白質交互作用的方法，由不同狀態下基因改變的強度來推論可能的路徑片段。 在此同時，我們要為本研究來設計一個工具，並且運用多種癌症的基因表現資料 來驗證它。由我們的方法產生的結果將與各種路徑預測法（如：最短路徑法、 NetSearch 法…等）的路徑預測方法來做比較。這個研究應可證明蛋白質交互作 用搭配基因表現的改變強度來推論的路徑，在生物學上可以更具有意義。期待本 方法能夠對於癌症的治療提供一個新的視野。