病例親本對照資料下,父親或母親資料遺失之Rare variants與疾病之相關性研究

以往，基因和疾病相關性的探索中，由於資料定序技術的關係()，定序出的基因位點其MAFs (allele minor frequency)皆大於等於5%，從中找出多(單)基因和疾病的關聯性，哪些才是對疾病產生作用的候選基因？這些候選基因稱為common variants(CVs)，很多的方法中皆提及，CVs只能解釋少許的變異，無論以家庭為基礎或族群為基礎。近年，也因科技的進步而再定序資料（resequencing data），其資料的MAFs<0.001且有較高的風險致病，學者提出了RVs影響疾病的說法。在某段基因是由多數個RVs所組成，只要其中部份RVs基因(不固定位子)傾向出現致病之風險的對偶基因，此情形稱機能性的RVs(functional RVs)，即能解釋疾病的發生。依我們研究發現的這類型的資料並不能使用過去分析CVs的方法，會有過大的型Ｉ錯誤率。因此，我們已提出相對的方法，來解決這問題，和其他方法比較，有較佳的檢定力。不過，當有資料遺失時，是值得討論，而此研究主要目的，是在病例親本對照研究下，收集RVs的資料，若考慮父或母親資料遺失時，利用傳遞與不傳遞風險對偶基因的概念找出最佳的檢定方法，來發現疾病和基因間的相關性。這方法亦可在GWAS（genome-wide）及再定序資料皆可使用，對於實際資料的分析十分有幫助。