Predicting Antimicrobial Resistances through Snps Extracted from Microbial Pan-Genome

Project: A - Government Institutionb - National Science and Technology Council

Project Details

Description

本計畫主要是想要了解致病菌的基因單位點變異與抗生素抗藥性之間的關聯性,挖掘出與抗藥性有著強烈關聯性的單位點變異後建立抗藥性預測模型,並透過分析基因突變的分布與趨勢了解抗生素如何對細菌產生演化壓力。本計畫不但可以提供生命科學上的知識性突破,了解並建構細菌單位點變異的跨物種演化分布與突變趨勢,並將透過機器學習特徵選取演算法建立更為準確的抗藥性預測模型。因此本計畫不但能夠在基礎生命科學上有所貢獻,在醫療場域的感染科及時診斷與治療上也將能夠提供計算上的協助。
StatusActive
Effective start/end date8/1/257/31/26

Keywords

  • Antimicrobial resistance
  • pan-genome
  • Single nucleotide polymorphism
  • SNP
  • Feature selection
  • de Bruijn graph